治疗滴虫的最佳方法是使用甲硝唑或替硝唑进行口服，同时性伴侣也需要接受治疗。
滴虫性阴道炎是由阴道毛滴虫引起的常见阴道炎症，也是常见的性传播疾病之一。其传播途径主要为经性交直接传播，也可经公共浴池、浴盆、游泳池、坐式便器、衣物等间接传播。滴虫阴道炎患者的阴道分泌物中会有大量的滴虫，所以滴虫性阴道炎常伴有泌尿生殖系统及肠道内的滴虫感染，而且滴虫可以吞噬精子，从而引起不孕症。
甲硝唑和替硝唑是硝基咪唑类衍生物，对滴虫有强大的杀灭作用，且口服吸收好，是目前治疗滴虫病的首选药物。服用药物后，药物可通过血-脑脊液屏障，对各种厌氧菌具有较高的抗菌活性，对阴道毛滴虫也有较强的杀灭作用。
需要注意的是，在治疗期间，应避免饮酒，因为甲硝唑和替硝唑可引起戒酒硫样反应，出现头痛、恶心、呕吐、腹痛、呼吸困难等症状，严重时可能危及生命。同时，性伴侣也需要接受治疗，以避免交叉感染。此外，患者还应注意个人卫生，保持外阴清洁，勤换内裤，治疗期间避免性生活。