孕早期发烧39度对胎儿的影响较大，可能会导致胎儿神经管发育缺陷。因此，需要及时采取措施来降温，以下是一些建议：
1.物理降温：使用温水擦拭身体，尤其是颈部、腋窝、肘窝、腹股沟等大血管丰富的部位，也可以使用退热贴。
2.药物治疗：如果物理降温效果不佳，可以在医生的指导下使用对乙酰氨基酚等退烧药。
3.就医：如果发烧持续时间较长或伴有其他症状，如头痛、咳嗽、喉咙痛等，应及时就医，以便明确病因并进行治疗。
需要注意的是，在就医时应告知医生自己的孕龄，以便医生选择合适的治疗方法。此外，在孕期应注意保持良好的生活习惯，如合理饮食、适量运动、保持充足的睡眠等，以提高身体免疫力，预防疾病的发生。