月经不干净总有褐色分泌物，可能是以下原因引起：
1.黄体功能不全：黄体功能不全可能导致子宫内膜不规则脱落，使月经周期缩短，经期延长，出现月经淋漓不尽的情况。
2.子宫内膜息肉：子宫内膜息肉是一种良性病变，可能导致月经间期出血、经量增多、经期延长等症状。
3.子宫肌瘤：子宫肌瘤可能影响子宫收缩，导致月经淋漓不尽。黏膜下肌瘤和较大的肌壁间肌瘤更易出现这种情况。
4.子宫内膜异位症：子宫内膜异位症可能导致盆腔粘连，影响子宫收缩，从而引起月经异常。
5.宫内节育器：宫内节育器可能引起子宫内膜无菌性炎症，导致月经淋漓不尽。
6.其他：妇科炎症、内分泌紊乱、子宫内膜癌等也可能导致类似症状。
如果出现月经不干净总有褐色分泌物的情况，建议及时就医，进行相关检查，如超声、性激素六项等，以明确病因，并采取相应的治疗措施。此外，保持良好的生活习惯，如规律作息、均衡饮食、适量运动等，也有助于改善月经异常的情况。
在治疗方面，医生可能会根据具体病因给予以下建议：
1.药物治疗：对于黄体功能不全、子宫内膜异位症等情况，可能会使用孕激素、避孕药等进行调理。
2.手术治疗：如果存在子宫内膜息肉、子宫肌瘤等病变，可能需要进行手术治疗，如宫腔镜下息肉切除术、子宫肌瘤剔除术等。
3.其他治疗：对于炎症引起的月经异常，可能会使用抗生素进行治疗。
需要注意的是，每个人的情况不同，治疗方法应根据具体情况而定。在治疗过程中，应遵循医生的建议，按时服药、定期复查，并注意个人卫生，保持良好的心态。如果症状持续不缓解或加重，应及时就医复诊。此外，对于青春期和更年期的女性，如果出现月经异常，应及时就医，排除器质性病变的可能。