奥美拉唑肠溶胶囊和奥美拉唑碳酸氢钠胶囊的区别在于：
1.成分不同：奥美拉唑肠溶胶囊的主要成分是奥美拉唑，奥美拉唑碳酸氢钠胶囊则是由奥美拉唑和碳酸氢钠组成。
2.作用机制不同：奥美拉唑是一种质子泵抑制剂，通过抑制胃酸分泌起作用；碳酸氢钠是一种碱性药物，主要用于中和胃酸。
3.适应症不同：奥美拉唑肠溶胶囊适用于胃溃疡、十二指肠溃疡、应激性溃疡、反流性食管炎等疾病；奥美拉唑碳酸氢钠胶囊适用于缓解胃酸过多引起的胃痛、胃灼热感（烧心）、反酸。
4.用法用量不同：奥美拉唑肠溶胶囊一般口服，一次20mg~60mg，一日1~2次；奥美拉唑碳酸氢钠胶囊一般口服，一次1~2粒，一日3次。
5.不良反应不同：奥美拉唑肠溶胶囊的不良反应主要有头痛、腹泻、恶心、腹痛、胃肠胀气等；奥美拉唑碳酸氢钠胶囊的不良反应主要有呃逆、腹胀、腹痛等。
6.禁忌不同：对奥美拉唑或其他苯并咪唑类药物过敏者禁用奥美拉唑肠溶胶囊；对奥美拉唑、碳酸氢钠过敏者禁用奥美拉唑碳酸氢钠胶囊。
需要注意的是，这两种药物都应在医生的指导下使用，不得自行增减剂量或更改用药方案。同时，在使用过程中如出现严重不适或过敏反应，应立即停药并就医。