口腔真菌感染可以使用药物治疗，一般以外用药物为主，严重时也需要口服药物，具体如下：
1.一般治疗：注意口腔卫生，在饭后使用小苏打水漱口，有助于维持口腔环境的酸碱平衡，抑制真菌生长。同时，避免使用广谱抗生素、免疫抑制剂等可能导致菌群失调的药物。
2.外用药物：
碳酸氢钠溶液：即小苏打水，具有抗真菌作用，可以用于口腔真菌感染的治疗。使用时将碳酸氢钠溶液稀释后漱口，每天数次。
氯己定溶液：氯己定溶液具有广谱抗菌作用，也可用于治疗口腔真菌感染。使用方法同上。
酮康唑乳膏：如果真菌感染局限于口腔黏膜，可在清洁口腔后，将酮康唑乳膏直接涂于患处。
3.口服药物：
氟康唑：适用于口腔念珠菌病等严重的真菌感染。口服氟康唑时，需遵循医生的建议，按照剂量和疗程服用。
伊曲康唑：对于某些难以治愈的口腔真菌感染，可能需要使用伊曲康唑。服用方法较为复杂，需在医生指导下进行。
需要注意的是，口腔真菌感染的治疗应在医生的指导下进行，尤其是对于免疫功能低下、长期使用抗生素或激素的患者。此外，在治疗过程中，应注意观察症状的变化，如有加重或持续不缓解，应及时就医。同时，应避免与他人共用口腔器具，以防交叉感染。