上完大便后肛门疼痛，可能是以下原因引起：
1.肛裂：肛管皮肤全层纵行裂开并形成感染性溃疡，典型表现为肛门疼痛、便秘和出血。肛门视诊可发现肛裂“三联征”，即肛裂、前哨痔和肛乳头肥大。
2.外痔：肛缘皮下静脉丛破裂或血栓形成，引起肛缘皮下痛性肿块。
3.肛管直肠周围脓肿：起病急，疼痛剧烈，伴有发热、乏力等全身感染症状。肛门周围脓肿最常见，多由肛腺感染经外括约肌皮下部向外或直接向外扩散而成。
4.血栓性外痔：肛门部突然剧烈疼痛，并有暗紫色血块。
5.内痔嵌顿：多有内痔病史，病情突发，疼痛剧烈，肛门部肿物不能还纳或还纳后又立即脱出。
6.其他：肛门直肠神经官能症、耻骨直肠肌综合征等也可引起肛门疼痛。
总之，引起肛门疼痛的原因较多，需要及时就医，明确诊断，以便进行针对性治疗。