儿童上呼吸道感染反复发烧，可在医生的指导下使用以下药物：
1.退烧药：如对乙酰氨基酚或布洛芬，可缓解发热症状，帮助孩子舒适度过发热期。
2.抗病毒药物：如果明确是病毒感染，且症状不严重，一般不需要使用抗病毒药物。但如果症状持续加重或出现其他异常，医生可能会根据具体情况使用利巴韦林等抗病毒药物。
3.抗生素：上呼吸道感染多由病毒引起，抗生素对病毒无效。但如果孩子出现咳黄痰、流脓涕等症状，或明确合并细菌感染，医生可能会使用抗生素，如阿莫西林、头孢克洛等。
4.清热解毒药物：此类药物有一定的抗病毒作用，可缓解发热、咽痛等症状，如双黄连口服液、蒲地蓝消炎口服液等。
5.对症治疗药物：如果孩子咳嗽，可以使用止咳祛痰药，如氨溴索、氨溴特罗等；如果鼻塞流涕严重，可以使用减充血剂，如伪麻黄碱等。
需要注意的是，药物的使用应严格遵循医生的建议，按照剂量和使用方法正确用药。同时，要密切观察孩子的病情变化，注意休息、多饮水，保持室内空气流通。如果孩子的症状持续不缓解或出现加重，应及时就医，以免延误病情。此外，不建议自行使用药物进行治疗，以免引起药物不良反应。