女性小肚子隐隐作痛可能由多种原因引起，以下是一些常见的病因：
1.排卵痛：
病因：成熟的卵子从卵巢排出时，会冲破包裹卵子表面的一层薄膜滤泡，滤泡内的少量液体就会流入盆腔，导致下腹部位出现坠胀感，这就是排卵痛。
原理：卵子排出时，滤泡内的少量液体流入盆腔，刺激盆腔腹膜，可能会导致下腹坠胀、疼痛等不适。
2.痛经：
病因：行经前后或月经期出现下腹疼痛、坠胀，伴有腰酸或其他不适，症状严重影响生活质量者。
原理：痛经分为原发性痛经和继发性两类，原发性痛经指生殖器官无器质性病变的痛经，占痛经90%以上；继发性痛经指由盆腔器质性疾病引起的痛经。
3.炎症：
病因：女性内生殖器官及其周围结缔组织、盆腔腹膜发生炎症时，可引起女性下腹部坠胀、疼痛及腰骶部酸痛，常在劳累、性交后及月经前后加剧。
原理：炎症可导致局部组织充血、水肿，刺激末梢神经，从而引起腹痛。
4.宫外孕：
病因：受精卵在子宫体腔以外着床称为异位妊娠，习称宫外孕。以输卵管妊娠最常见。
原理：宫外孕时，随着孕囊的生长，会导致输卵管破裂或流产，引起腹腔内出血，刺激腹膜，导致腹痛。
5.黄体破裂：
病因：正常情况下，黄体内有少量出血，但如果出血太多，就可能增加黄体内的压力，从而发生自发性破裂。
原理：黄体破裂后，血液会积聚在盆腔，刺激腹膜，引起腹痛。
6.卵巢囊肿蒂扭转：
病因：当卵巢囊肿增大到一定程度时，会由于重力作用发生扭转，引起卵巢缺血坏死，从而导致腹痛。
原理：卵巢囊肿蒂扭转后，供应卵巢囊肿的血管被扭转，导致卵巢缺血，从而引起疼痛。
以上是一些可能导致女性小肚子隐隐作痛的原因，如果疼痛持续不缓解或伴有其他症状，建议及时就医，以便明确病因并进行相应的治疗。