曲克芦丁脑蛋白水解物的主要作用是改善脑部血液循环，营养脑神经，同时可用于治疗脑动脉硬化、脑血栓、脑栓塞、脑血管痉挛等脑血管疾病，以及颅脑外伤及脑外伤后遗症、脑炎及脑膜炎后遗症、急性脑梗死、急性脑出血等疾病。
需要注意的是，使用该药物可能会出现过敏反应，如皮疹、皮肤瘙痒、呼吸困难等，严重时可能会导致过敏性休克。因此，在使用前需要进行皮试，皮试阳性者禁止使用。此外，该药物还可能会引起发热、寒战、头痛等不良反应，一般停药后即可恢复正常。对该药物过敏者、严重肾功能不全者、孕妇及哺乳期妇女禁用。该药物为处方药，需要在医生的指导下使用，严格按照说明书的剂量和使用方法服用，不得擅自增减剂量或延长用药时间。同时，在使用过程中应注意观察药物的不良反应，如出现严重不适或过敏反应，应及时就医。