脑干出血不能自主呼吸，是一种非常严重的情况，需要立即采取以下措施：
1.保持呼吸道通畅：及时清除口腔和鼻腔内的分泌物，确保呼吸顺畅。
2.机械通气：使用呼吸机辅助呼吸，帮助患者维持正常的氧气供应和二氧化碳排出。
3.控制血压：脑干出血后，血压往往会升高，需要及时使用降压药物，控制血压在合适的范围内。
4.治疗病因：针对脑干出血的病因进行治疗，如控制高血压、治疗动脉瘤等。
5.支持治疗：给予患者营养支持、维持水电解质平衡、预防并发症等。
总之，脑干出血不能自主呼吸是一种危急重症，需要及时就医，采取综合治疗措施，以提高患者的生存率和生活质量。