自然流产后干净了又出血，可能是以下原因引起：
1.子宫收缩不良：自然流产后，子宫需要收缩以关闭血管并排出剩余的组织。如果子宫收缩不良，可能会导致出血。可以使用子宫收缩药物，如催产素，来促进子宫收缩。
2.残留组织：即使自然流产后，子宫内可能仍然残留一些组织，如胎盘碎片或胎膜。这些残留组织可能会导致出血。医生可能会建议进行清宫手术，以清除残留组织。
3.感染：自然流产后，子宫容易感染。感染会导致子宫内膜炎症，从而引起出血。可以使用抗生素来治疗感染。
4.内分泌失调：自然流产可能会影响女性的内分泌系统，导致激素水平失衡。这可能会影响子宫内膜的生长和修复，导致出血。医生可能会建议进行激素治疗来调整内分泌。
如果自然流产后干净了又出血，建议及时就医，进行详细的检查和诊断。医生会根据具体情况制定相应的治疗方案。同时，患者应注意休息，避免劳累和性生活，保持外阴清洁，预防感染。