月经不干净通常是指月经持续时间较长，超过7天仍有阴道流血。在这种情况下，是否可以进行B超检查需要根据具体情况来决定。以下是一些需要考虑的因素：
1.原因：首先，需要明确月经不干净的原因。常见的原因包括子宫肌瘤、子宫内膜息肉、子宫腺肌病、内分泌紊乱等。如果是由于这些原因导致的月经不干净，B超检查可以帮助医生了解子宫和盆腔的情况，确定病因。
2.出血量：如果月经量较多，B超检查可能会受到影响，导致结果不准确。在这种情况下，可以考虑先进行止血治疗，待月经量减少后再进行B超检查。
3.其他检查：除了B超检查外，医生可能还会建议进行其他检查，如血常规、性激素六项、甲状腺功能等，以进一步明确病因。
4.注意事项：
检查时间：最好在月经干净后3-7天进行B超检查，此时子宫内膜较薄，检查结果更准确。
憋尿：检查前需要憋尿，使膀胱充盈，以便更好地观察子宫和盆腔的情况。
告知医生：在检查前，应告知医生自己的月经情况、病史、用药情况等，以便医生做出更准确的诊断。
总之，月经不干净时是否可以进行B超检查需要根据具体情况来决定。如果对月经不干净的情况有疑虑，建议及时就医，遵医嘱进行相关检查和治疗。