一、增加感染风险
大姨妈没走干净时，子宫颈口处于相对开放状态，此时带套同房容易将外界细菌等病原体带入阴道、子宫等生殖器官内，引发感染。例如，可能导致阴道炎，出现阴道瘙痒、分泌物异常等症状；还可能引起子宫内膜炎，出现下腹部疼痛、异常阴道出血等情况，这是因为细菌逆行感染至子宫内膜，炎症刺激会影响子宫内膜的正常修复等功能。对于女性而言，不同年龄阶段的生殖系统防御能力有所不同，年轻女性生殖系统相对较为娇嫩，感染风险相对更高；而有过流产史、妇科疾病史等特殊病史的女性，本身生殖系统抵御感染的能力就较弱，在大姨妈没走干净带套同房后，感染的可能性会进一步增大。
二、影响月经周期和经量
大姨妈没走干净时同房，可能会对内分泌系统产生影响，进而干扰月经周期和经量。性兴奋可能会引起子宫收缩，而子宫收缩可能会导致尚未完全修复的子宫内膜再次少量出血，使经期延长、经量增多。比如原本月经快结束了，经量已经很少，同房后可能又出现较多阴道出血情况。从年龄角度看，青春期女性内分泌系统还未完全发育成熟，月经周期本身就不太稳定，大姨妈没走干净带套同房后对月经周期和经量的影响可能更为明显；育龄期女性如果经常出现这种情况，可能会打乱原本相对规律的月经周期；围绝经期女性本身月经就处于紊乱阶段，大姨妈没走干净带套同房后对月经的影响会加重月经失调的程度。有过月经不调病史的女性，在大姨妈没走干净时带套同房，更容易出现月经周期和经量的异常变化。
三、增加子宫内膜异位症风险
大姨妈没走干净时，子宫内膜有创面，带套同房时的子宫收缩等动作可能会促使子宫内膜组织逆流入盆腔，种植在盆腔其他部位，从而增加子宫内膜异位症的发生风险。子宫内膜异位症会导致痛经进行性加重、不孕等问题。对于不同生活方式的女性，长期久坐、缺乏运动等不良生活方式可能会影响盆腔血液循环，使得子宫内膜异位症的发生风险相对升高；而经常运动的女性相对风险可能稍低，但大姨妈没走干净带套同房这一行为仍会增加其患病几率。有家族中有子宫内膜异位症病史的女性，本身就属于高危人群，大姨妈没走干净带套同房会进一步加大患病风险。
四、对男性的潜在影响
虽然主要是对女性有较大影响，但对于男性而言，在大姨妈没走干净时带套同房，女性的经血可能会接触到男性的生殖器官等部位，可能会引起男性局部的不适，比如阴茎部位的瘙痒等情况，不过相对女性来说，男性受到的直接影响相对较小，但也不能忽视。不同年龄的男性，生殖系统的敏感度和抵抗力有所不同，年轻男性生殖系统相对较为敏感，可能更容易出现不适反应；而年龄稍大的男性相对抵抗力稍强，但也应注意避免这种情况对自身可能产生的潜在影响。有生殖系统疾病病史的男性，在这种情况下受到的影响可能会更明显，比如本身有龟头炎等疾病，接触经血后可能会加重炎症等情况。