手指甲有小坑坑，可能是以下原因引起：
1.甲癣：
由皮肤癣菌感染甲板及甲下所致。
可表现为指甲浑浊、增厚、表面凹凸不平，颜色改变，还可能出现甲板与甲床分离。
常由足癣直接传染，或经手癣搔抓后自体传染引起。
2.银屑病：
一种慢性炎症性皮肤病。
除了皮肤损害，指甲也可能受累，出现顶针状凹陷、变色、增厚、易碎等表现。
银屑病还可能伴有关节炎、脓疱等症状。
3.斑秃：
病因不明，可能与遗传、自身免疫、精神因素等有关。
斑秃患者可在脱发的同时，出现指甲上的小坑坑，表现为甲板上出现多数针头大小的凹陷，呈顶针状。
4.扁平苔藓：
一种皮肤黏膜慢性炎症性疾病。
可累及皮肤、指甲，出现紫红色多角形扁平丘疹，指甲可出现纵嵴、纵沟、点状凹陷等。
5.湿疹：
由多种内外因素引起的皮肤炎症反应。
当手部湿疹时，指甲可能受到影响，出现小坑坑、甲板混浊、增厚、游离端与甲床分离等表现。
6.营养不良：
某些营养素缺乏，如维生素、微量元素等，可能导致指甲营养不良，出现小坑坑等异常。
7.其他：
系统性疾病，如心脏病、肝硬化等；
药物副作用；
外伤等也可能引起指甲异常。
如果发现手指甲有小坑坑，建议及时就医，进行相关检查，以明确原因，并采取相应的治疗措施。同时，要注意保持指甲清洁，避免搔抓和损伤，避免接触刺激性物质。对于特殊人群，如孕妇、儿童、老年人等，应更加关注指甲的变化，如有异常应及时就医。