慢性萎缩性胃炎伴胃窦糜烂的治疗需综合多方面因素，一般包括去除病因、药物治疗等。
一、病因去除方面
首先要避免可能损伤胃黏膜的因素，如戒烟限酒，因为吸烟和过量饮酒会加重胃黏膜损伤；还要避免服用非甾体类抗炎药等可能损害胃黏膜的药物，若因病情需要必须服用，需在医生指导下权衡利弊。
二、药物治疗要点
使用抑制胃酸分泌的药物，如质子泵抑制剂，可减少胃酸对胃黏膜的刺激；还可使用胃黏膜保护剂，促进胃窦糜烂处的修复。对于有幽门螺杆菌感染的患者，需进行规范的抗幽门螺杆菌治疗。
三、特殊人群注意事项
老年患者身体机能下降，在治疗时要更谨慎选择药物，密切关注药物不良反应；儿童患者若患病，应优先考虑非药物干预方法，如调整饮食等，且用药需严格遵循儿科安全护理原则，避免使用不适合儿童的药物。
四、生活方式调整
患者要保持规律的生活作息，避免过度劳累，因为劳累可能影响胃黏膜的修复；同时要注意饮食规律，进食易消化、少刺激的食物，如小米粥等，避免食用辛辣、油腻、过冷过热的食物，以减轻胃的消化负担，利于病情恢复。