三个月宝宝坐飞机对耳朵危害不大。
一般来说，宝宝的咽鼓管较短、宽且平直，相较于成人，其咽鼓管功能较差，鼻咽部的液体更容易通过咽鼓管进入中耳，引发中耳炎。但这种情况在宝宝出生后3~5个月时逐渐改善，且飞机在上升或下降过程中，周围气压变化较大，对中耳的影响也相对较小。
因此，三个月宝宝坐飞机对耳朵危害不大，但家长仍需注意以下几点，以降低对宝宝耳朵的影响：
1.在飞机起降时，给宝宝喂奶或喂水，通过吞咽来打开咽鼓管，平衡中耳内外气压。
2.也可以用手轻轻按压宝宝的耳朵，帮助打开咽鼓管。
3.保持宝宝清醒，避免哭闹，以免增加中耳压力。
4.如果宝宝有鼻塞或感冒等情况，最好等症状缓解后再坐飞机。
需要注意的是，每个宝宝的情况都不同，如果家长对宝宝坐飞机有任何疑虑，建议在出发前咨询医生。