当体检发现肺部、甲状腺等部位有结节，并且伴有钙化时，可能是以下原因引起。
1.良性疾病：
炎症：比如肺结核、肺炎等疾病在恢复后，可能会出现结节钙化。
增生：如果长期存在组织损伤，可能会出现增生性病变，从而导致结节钙化。
退变：人体的正常组织和器官随着年龄的增长，可能会出现退行性改变，从而导致结节钙化。
2.恶性肿瘤：
癌症：部分癌症在生长过程中，可能会出现营养不良性钙化。
转移：如果恶性肿瘤发生转移，也可能会导致结节钙化。
一般来说，结节钙化的大小、形态、数量等特征，对于判断结节的性质有一定的帮助。如果结节钙化较小，没有明显的症状，一般不需要特殊处理，定期复查即可。如果结节钙化较大，或者伴有明显的症状，可能需要进一步检查或治疗。
需要注意的是，结节钙化并不一定意味着患有癌症，也可能是良性疾病引起的。如果发现结节钙化，建议及时就医，医生会根据具体情况进行综合分析和判断，并给出相应的建议。