沙眼衣原体阳性是由沙眼衣原体感染引起的。沙眼衣原体是一种能通过细菌滤器的原核细胞型微生物，主要引起沙眼、包涵体结膜炎、泌尿生殖道感染、性病淋巴肉芽肿以及母婴传播。
沙眼衣原体感染后，其表面脂多糖（LPS）的内毒素可引起局部炎症反应。如果病变累及结膜，可导致滤泡增生、乳头肥大、结膜充血及角膜血管翳，形似沙粒，故名沙眼。
沙眼衣原体感染引起的包涵体结膜炎，可累及咽、眼-结膜-鼻咽部，常通过性接触传播。
泌尿生殖道沙眼衣原体感染，多表现为尿道炎、宫颈炎、盆腔炎等，孕妇感染还可能导致胎膜早破、早产等。
性病淋巴肉芽肿是沙眼衣原体感染引起的性传播疾病，主要通过性接触传播。
母婴传播可导致新生儿结膜炎和肺炎。
治疗沙眼衣原体感染，通常根据不同的病症采取不同的治疗方法。对于眼部感染，可使用抗生素眼药水或眼膏；对于泌尿生殖道感染，可使用抗生素进行治疗；对于性病淋巴肉芽肿，早期使用四环素、红霉素等药物可取得良好疗效。
此外，注意个人卫生、避免不洁性行为、使用公共卫生用品时注意消毒等，有助于预防沙眼衣原体感染。