手指甲缝疼的原因比较复杂，可能与感染、外伤、甲沟炎等有关。以下是一些常见的原因：
1.感染：细菌、真菌等微生物感染甲沟部位，可引起甲沟炎，出现甲沟红肿、疼痛，甚至化脓。
2.外伤：手指受到挤压、碰撞等外伤，导致甲床或甲沟受损，也会引起疼痛。
3.嵌甲：趾甲（指甲）嵌入甲沟，导致甲沟组织受到刺激和损伤，容易引发感染，引起疼痛。
4.其他：银屑病、扁平苔藓等皮肤病，也可能导致手指甲缝疼。
治疗方法主要根据病因进行选择，包括以下几种：
1.抗感染治疗：如果是感染引起的，需要使用抗生素（如阿莫西林、头孢呋辛酯等）进行抗感染治疗。
2.局部处理：对于甲沟炎或外伤引起的疼痛，可先用碘伏消毒，然后涂抹莫匹罗星软膏（百多邦）、夫西地酸乳膏等抗生素软膏。如果有化脓，需要在医生的指导下切开引流。
3.纠正嵌甲：对于嵌甲，需要及时修剪趾甲，避免趾甲嵌入甲沟。如果嵌甲比较严重，可能需要手术治疗。
4.治疗原发病：如果是皮肤病引起的，需要积极治疗原发病。
需要注意的是，手指甲缝疼的原因可能比较复杂，如果疼痛持续不缓解或加重，建议及时就医，明确病因，以便进行针对性治疗。同时，要注意保持手指清洁，避免感染。