治疗肾结石的最好方法是根据结石的大小、位置、数量、成分等因素来选择个体化的治疗方案，没有一种方法适用于所有的肾结石患者。一般来说，治疗肾结石的方法包括以下几种：
1.保守治疗：适用于直径小于0.6厘米、表面光滑、无尿路梗阻、无感染的肾结石患者。治疗方法主要是多喝水、多运动、配合排石药物，促进结石排出。保守治疗的优点是无创、费用低，但缺点是排石时间长、成功率低，有些患者可能需要多次治疗或改行其他方法。
2.体外冲击波碎石：适用于直径小于2厘米的肾结石患者。治疗原理是利用体外冲击波聚焦后击碎结石，然后随尿液排出体外。体外冲击波碎石的优点是微创、恢复快，但缺点是有一定的局限性，如结石位置不好、过于坚硬等可能导致碎石效果不佳或需要多次碎石。
3.输尿管镜取石或碎石：适用于输尿管中下段的肾结石患者。治疗方法是通过输尿管镜插入尿道、膀胱、输尿管，到达结石部位，然后用激光、气压弹道或超声等方式将结石击碎取出。输尿管镜取石或碎石的优点是微创、恢复快，但缺点是需要局部麻醉或全身麻醉，有一定的风险和并发症，如输尿管损伤、感染等。
4.经皮肾镜取石或碎石：适用于较大或复杂的肾结石患者。治疗方法是在腰部建立一个通道，插入肾镜，通过超声或X线定位找到结石，然后用激光、气压弹道或超声等方式将结石击碎取出。经皮肾镜取石或碎石的优点是微创、效果好，但缺点是创伤较大、风险较高，需要全身麻醉，术后可能有出血、感染等并发症。
5.开放手术取石：适用于一些特殊情况的肾结石患者，如巨大的鹿角形结石、肾内型肾盂输尿管连接部梗阻等。治疗方法是在腰部做一个较大的切口，切开肾脏取出结石。开放手术取石的优点是彻底、有效，但缺点是创伤大、恢复慢，有一定的死亡率和并发症发生率。
总之，治疗肾结石的最好方法是根据患者的具体情况选择最合适的方法，有时可能需要多种方法联合应用。患者在治疗前应进行详细的检查和评估，与医生充分沟通，了解各种治疗方法的优缺点和风险，然后做出明智的选择。同时，患者在治疗后也应注意预防结石的复发，如调整饮食、多喝水、定期复查等。