跑步右下腹部隐痛的原因可能是运动不当、阑尾炎、右侧输尿管结石等。以下是具体分析：
1.运动不当：
病因：跑步时，右下腹部的肌肉、韧带等组织会受到牵拉和刺激，如果运动前没有做好充分的热身准备，或者运动强度过大、时间过长，就容易导致这些组织损伤，引起疼痛。
原理：运动时肌肉收缩，需要大量的能量供应。如果能量供应不足，就会导致肌肉缺氧，产生乳酸等代谢产物，刺激神经末梢，引起疼痛。
治疗方法：休息、热敷、按摩等。
2.阑尾炎：
病因：阑尾位于右下腹部，当阑尾发生炎症时，会导致右下腹部疼痛，同时还可能伴有恶心、呕吐、发热等症状。
原理：阑尾管腔阻塞、细菌感染等原因可引起阑尾炎症，导致阑尾肿胀、坏死，刺激周围神经末梢，引起疼痛。
治疗方法：手术治疗（如阑尾切除术）。
3.右侧输尿管结石：
病因：输尿管结石可导致输尿管堵塞，引起肾积水、肾盂肾炎等，从而导致右下腹部疼痛，同时还可能伴有血尿、尿频、尿急等症状。
原理：结石刺激输尿管黏膜，引起输尿管痉挛，导致疼痛。
治疗方法：保守治疗（如多喝水、运动等）或手术治疗（如体外冲击波碎石术、输尿管镜取石术等）。
总之，跑步右下腹部隐痛的原因较多，如果疼痛持续不缓解或伴有其他症状，应及时就医，明确病因，以便进行针对性治疗。