包茎手术吻合器的缺点主要包括以下几个方面：（一）价格较高。（二）手术时间较长。（三）可能出现并发症。（四）需要专业医生操作。（五）术后恢复时间较长。（六）可能影响性生活。（七）存在二次手术的可能。
价格较高是包茎手术吻合器的一个缺点，因为它是一种医疗器械，需要较高的成本。手术时间较长也是一个问题，因为需要使用吻合器将龟头和包皮固定在一起。此外，使用吻合器可能会出现一些并发症，如出血、感染等。需要专业医生操作，因为如果操作不当，可能会导致手术失败或出现其他问题。术后恢复时间较长，因为需要等待伤口愈合。可能影响性生活，因为手术后龟头可能会变得敏感，需要一段时间来适应。最后，使用吻合器进行包茎手术可能需要进行二次手术，以去除吻合钉。