三岁宝宝脸上起红疙瘩，可能由多种原因引起，以下是一些常见的治疗方法：
1.湿疹：如果红疙瘩伴有瘙痒、脱屑等症状，可能是湿疹。可以使用湿疹膏、氧化锌软膏等药物涂抹，同时注意保持皮肤清洁、湿润。
2.过敏：如果宝宝吃了某些食物或接触了某些物质后出现红疙瘩，可能是过敏引起的。需要避免接触过敏原，并使用抗过敏药物，如氯雷他定、西替利嗪等。
3.感染：如果红疙瘩周围有红肿、发热等症状，可能是感染引起的，如脓疱疮、疖肿等。需要使用抗生素软膏，如百多邦、红霉素软膏等涂抹，并注意皮肤清洁。
4.蚊虫叮咬：如果红疙瘩是蚊虫叮咬引起的，可以使用炉甘石洗剂、风油精等涂抹。
5.其他：如果红疙瘩持续不消退或加重，或者宝宝出现发热、咳嗽等症状，需要及时就医，以确定病因并进行相应的治疗。
需要注意的是，以上治疗方法仅供参考，具体用药需要根据宝宝的具体情况在医生的指导下使用。同时，要注意保持宝宝的皮肤清洁，避免搔抓，避免接触过敏原，饮食清淡，避免食用辛辣、刺激性食物。如果宝宝症状加重或出现其他不适，应及时就医。