肚脐眼发臭可能是感染、脐尿管未闭、脐尿管瘘等原因所致，可以通过一般治疗、药物治疗、手术治疗的方式进行治疗，建议及时就医。具体分析如下：
1.感染：肚脐眼是一个容易藏污纳垢的地方，如果平时不注意清洁，或者肚脐眼受到了损伤，细菌就容易在里面滋生，导致感染。感染后，肚脐眼会出现红肿、疼痛、有异味等症状。
2.脐尿管未闭：在胎儿时期，脐尿管是连接膀胱和外界的通道，在出生后，脐尿管会逐渐闭锁，如果脐尿管未闭，就会导致肚脐眼发臭。
3.脐尿管瘘：脐尿管瘘是指脐尿管的两端闭合，中间有一个窦道相通，导致尿液从窦道中排出，从而引起肚脐眼发臭。
患者在治疗期间需要注意保持肚脐眼的清洁干燥，可适当食用富含维生素的食物，避免食用辛辣、刺激性食物，如辣椒、花椒、生姜等。