女性小腹子宫部位疼痛可能由多种原因引起，以下是一些常见的原因：
1.排卵性腹痛：青春期女孩在排卵时，卵泡破裂，卵泡液对腹膜可能有一定的刺激作用，所以她们有时会出现左右交替的、每月一次的轻微腹痛。这属于生理性的，表现多为一侧性下腹隐痛、钝痛或坠胀样疼痛，部分少女同时伴有少许阴道出血，即排卵期出血，多在一两天后自行消失，一般不超过七天。这种腹痛多无任何病理改变，妇科检查也完全正常，属于生理性腹痛，一般不需处理。
2.痛经：痛经分原发性与继发性痛经两种。原发性痛经常见于青春期少女，原因与体内前列腺素水平、寒冷、情绪心理因素有关。而继发性痛经常见原因为子宫内膜异位症及子宫腺肌症。表现为疼痛逐渐加重，多呈周期性发作，或非经期下腹有隐痛而行经前后加重。此外，常伴有不孕及月经失调，往往需要药物治疗。
3.卵巢黄体破裂：这是因黄体内出血较多所致，伴有突然发作的下腹部或一侧的腹痛，严重时还可出现休克。卵巢黄体破裂绝大部分发生在月经周期的第20～26天，发病时可出现下腹部疼痛，轻重不一。卵巢黄体破裂的治疗方法因人而异。如果破口小、出血少，腹痛轻，可采用保守治疗；如果病情严重，出血量大，则需要手术治疗。
4.与妊娠有关的疾病：近年来，少女妊娠的病例并不少见，而她们在此之前所遭遇的误诊也屡见不鲜。卵巢妊娠、子宫外孕、子宫颈妊娠、难免流产、不全流产、过期流产、习惯性流产等都可能导致腹痛。其中卵巢妊娠是一种很危险的情况，因为卵巢不像子宫那样结实而富有弹性，卵巢一旦破裂，不仅出血量多，而且不易自行止血，还有可能危及生命。
5.急性阑尾炎：是一种少女常见的下腹部疼痛，其特点是转移性腹痛，即开始时在上腹部脐周围痛，经几小时或半天左右腹痛转移到右下腹部。多伴有恶心、呕吐、腹胀等。压痛是阑尾炎的主要体征，多在右下腹。
6.其他：如子宫内膜异位症、盆腔炎、盆腔静脉淤血综合征等，也可导致小腹子宫部位疼痛。
总之，女性小腹子宫部位疼痛可能是一种正常的生理现象，但也可能是某些疾病的表现。如果疼痛持续时间较长、程度较重或伴有其他症状，应及时就医，以便明确病因并进行相应的治疗。