睡醒后手指关节僵硬疼痛的原因有以下几点：
1.类风湿关节炎：是一种自身免疫性疾病，以侵蚀性、对称性多关节炎为主要临床表现。其病因尚不明确，可能与遗传、感染、性激素等有关。早期可出现手指、手腕等小关节肿胀、疼痛、晨僵，晚期可导致关节畸形。类风湿关节炎多发生于35~50岁女性，起病缓慢，常有低热、乏力、全身不适、手足发冷等前驱症状。
2.骨关节炎：是一种退行性病变，与衰老、肥胖、劳损、创伤、关节先天性异常等有关。手指骨关节炎常发生于远端指间关节，可出现关节肿胀、疼痛、畸形，晨僵时间一般较短。
3.腱鞘炎：是腱鞘因反复机械性摩擦而出现的慢性无菌性炎症。手指腱鞘炎好发于拇指、中指、环指，表现为手指屈伸时疼痛、弹响，严重时可出现手指屈伸受限。
4.其他：手指关节僵硬疼痛还可见于其他疾病，如银屑病关节炎、强直性脊柱炎、系统性红斑狼疮等。
如果出现睡醒后手指关节僵硬疼痛，建议及时就医，明确病因，以便进行针对性治疗。同时，应注意保暖，避免手指关节过度劳累，可适当进行手指关节的功能锻炼。