打了流感疫苗后才发现怀孕了，不必过于惊慌，可根据具体情况采取以下措施。
1.继续妊娠：如果已经怀孕，且各项指标正常，可考虑继续妊娠，但要注意按时产检，密切关注胎儿的发育情况。
2.终止妊娠：如果有先兆流产、胚胎停育等情况，或因个人原因不想要孩子，可在医生的指导下选择合适的终止妊娠方式。
3.补充叶酸：接种流感疫苗后发现怀孕，可及时补充叶酸，以预防胎儿神经管畸形。
4.注意休息：在接种流感疫苗后发现怀孕，要注意休息，避免过度劳累，保持良好的心态。
5.避免致畸因素：在接种流感疫苗后发现怀孕，要避免接触致畸因素，如放射线、化学物质等。
6.慎用药物：在接种流感疫苗后发现怀孕，如果需要用药，应在医生的指导下使用，避免使用对胎儿有影响的药物。
总之，打了流感疫苗后才发现怀孕了，应及时就医，医生会根据具体情况给出合理的建议。同时，要保持良好的心态，积极配合医生的治疗。