十二岁女孩来月经不正常可能是由于以下原因：
1.下丘脑-垂体-卵巢轴调节功能尚未健全：女孩在12岁左右，下丘脑-垂体-卵巢轴的功能尚未完全发育成熟，这个阶段的月经周期可能会出现不规律的情况。随着年龄的增长，这种情况会逐渐改善。
2.青春期功血：青春期功能性子宫出血是由于青春期卵巢功能及排卵机制还不完善，导致月经周期紊乱，出血量时多时少。这种情况一般不需要特殊治疗，随着卵巢功能的逐渐完善，月经会逐渐规律。
3.其他因素：情绪波动、环境改变、过度运动、营养不良等因素也可能影响月经周期。如果女孩在月经期间过度劳累、精神紧张、情绪波动等，可能会导致月经失调。
需要注意的是，如果女孩的月经周期异常持续时间较长，或者伴有其他症状，如腹痛、贫血等，应及时就医，进行相关检查和治疗。同时，家长应注意引导女孩养成良好的生活习惯，保持心情愉悦，注意保暖和营养，避免过度劳累和精神紧张。