阴茎根部两边皮肤反复瘙痒可能由多种原因引起，以下是一些可能的原因和建议：
1.真菌感染：如股癣，由皮肤癣菌感染引起，除了瘙痒，还可能伴有红斑、脱屑等症状。可以使用抗真菌药物治疗，如酮康唑乳膏、克霉唑乳膏等。同时，要注意保持局部清洁干燥，避免搔抓，以防感染扩散。
2.湿疹：湿疹是一种过敏性皮肤病，可发生于阴茎根部。表现为皮肤瘙痒、红斑、丘疹、水疱等。可以使用糖皮质激素乳膏、炉甘石洗剂等治疗。此外，要避免热水烫洗、过度搔抓，穿着宽松透气的内裤。
3.接触性皮炎：由于接触某些过敏原或刺激物引起，如避孕套、润滑剂、某些内裤材质等。应避免再次接触过敏原，同时使用糖皮质激素乳膏、氧化锌软膏等治疗。
4.疥疮：由疥螨感染引起，夜间瘙痒剧烈，可在阴茎根部出现丘疹、水疱、隧道等。可以使用硫磺软膏、苯甲酸苄酯乳膏等治疗。同时，要注意个人卫生，勤换内衣裤，煮沸消毒。
5.其他原因：如糖尿病、维生素缺乏、寄生虫感染等也可能导致阴茎根部皮肤瘙痒。此外，一些系统性疾病，如银屑病、扁平苔藓等也可能累及阴茎皮肤。
需要注意的是，以上只是一些常见的原因，具体原因需要根据患者的具体情况进行诊断。如果阴茎根部皮肤瘙痒持续不缓解或伴有其他症状，如疼痛、红肿、分泌物等，应及时就医，进行相关检查，以明确诊断，并采取相应的治疗措施。
对于特殊人群，如孕妇、儿童、老年人等，由于身体状况的特殊性，治疗方法可能有所不同。在使用药物治疗时，应遵循医生的建议，注意药物的安全性和适用性。此外，保持良好的个人卫生习惯，避免过度清洁和搔抓，穿着宽松透气的内裤，对于缓解瘙痒症状也非常重要。
总之，阴茎根部两边皮肤反复瘙痒可能是多种疾病的表现，需要及时就医，明确诊断，并采取相应的治疗措施。同时，注意个人卫生，避免搔抓和刺激，有助于缓解症状和促进康复。