月经干净后下腹部疼痛可能是以下几种疾病：
1.排卵性腹痛：月经干净后下腹疼痛可能是排卵性腹痛，这是一种生理现象。排卵时，卵泡破裂，卵泡液对腹膜产生刺激，通常会引起下腹部疼痛。这种疼痛一般持续1-2天，可伴有轻微的腰酸或下腹坠胀感。
2.子宫内膜异位症：子宫内膜异位症是导致月经干净后下腹部疼痛的常见原因之一。子宫内膜异位症是指子宫内膜组织生长在子宫腔以外的部位，如卵巢、子宫骶骨韧带、子宫直肠窝等。异位的子宫内膜在月经期间也会出血，但这些血液无法正常排出，从而导致疼痛。此外，还可能出现月经失调、性交痛、不孕等症状。
3.盆腔炎：盆腔炎是指女性盆腔生殖器官、子宫周围的结缔组织及盆腔腹膜的炎症。炎症可局限于一个部位，也可同时累及几个部位，最常见的是输卵管炎、输卵管卵巢炎。盆腔炎多发生在性活跃期、有月经的妇女，初潮前、绝经后或未婚者很少发生盆腔炎。下腹部疼痛是盆腔炎的主要症状之一，通常在月经干净后出现，还可能伴有发热、阴道分泌物增多等症状。
4.其他：子宫肌瘤、宫颈炎、子宫内膜息肉等疾病也可能导致月经干净后下腹部疼痛。
如果出现月经干净后下腹部疼痛，建议及时就医，进行相关检查，如B超、血常规、性激素六项等，以明确病因，并进行针对性治疗。此外，在日常生活中，要注意个人卫生，保持外阴清洁，避免不洁性生活；注意保暖，避免着凉；适当运动，增强体质。