耳结石通常是由于外耳道耵聍腺分泌过多，与外耳道脱落的上皮细胞等混合形成的团块。
耵聍腺分泌异常导致
外耳道的耵聍腺会持续分泌耵聍（耳垢），当分泌量过多，且排出不畅时，就容易逐渐积聚形成耳结石。比如一些人耵聍腺分泌较为旺盛，若外耳道狭窄、弯曲等，耵聍排出受阻，就增加了耳结石形成的风险。
外耳道局部因素影响
外耳道存在炎症、异物等情况时，会刺激耵聍腺分泌增多，同时影响耵聍的正常排出。例如外耳道反复发炎，炎症刺激使得耵聍腺分泌异常，加上炎症导致外耳道黏膜肿胀等，进一步阻碍耵聍排出，进而促使耳结石形成。
长期不良挖耳习惯
频繁、不当的挖耳会损伤外耳道皮肤，引起皮肤的炎性反应，同时也会破坏耵聍的正常排出通道，导致耵聍堆积。比如用尖锐器具过度挖耳，容易损伤外耳道，影响耵聍的自然排出，为耳结石的形成创造条件。
年龄因素影响
儿童和老年人相对更易出现耳结石问题。儿童的外耳道尚未完全发育成熟，耵聍排出功能相对较弱；老年人耵聍腺功能可能有所减退，且耳部肌肉松弛等，都使得耵聍排出不畅，增加耳结石形成几率。