扁桃体一侧肿大可能带来多方面危害。首先，可能影响呼吸，导致睡眠时打鼾甚至呼吸暂停，尤其儿童长期如此可能影响生长发育。其次，易引发反复感染，炎症反复刺激可能波及邻近组织，如引发中耳炎等。再者，肿大的扁桃体可能成为病灶，引发风湿热、肾炎等全身性疾病。另外，还可能影响吞咽功能，使进食有异物感或吞咽不适。
一、影响呼吸与睡眠
扁桃体一侧肿大可能导致气道狭窄，睡眠时气流通过受阻，出现打鼾现象，严重时会引起呼吸暂停。儿童长期处于这种状况，会影响夜间氧气摄入，进而影响生长激素分泌等，阻碍身体正常发育。
二、引发邻近组织感染
肿大的扁桃体作为局部病灶，细菌等容易滋生繁殖，炎症可能蔓延至邻近组织，比如波及耳部引发中耳炎，出现耳痛、听力下降等症状；还可能累及咽部周围组织，导致咽部其他部位炎症反复发作。
三、成为全身性疾病的病灶
当扁桃体一侧肿大处于慢性炎症状态时，其作为病灶可能引发全身性免疫反应，进而导致风湿热，出现关节疼痛、心脏炎等；还可能引发肾炎，表现为蛋白尿、水肿等症状，严重影响身体健康。
四、影响吞咽功能
肿大的扁桃体占据咽部空间，会使患者在吞咽时感觉有异物存在，产生吞咽不适或疼痛，长期可能影响进食量，导致营养摄入不足，尤其对儿童的生长发育可能产生不利影响。