先天性脑囊肿手术的费用一般在3万至10万元之间，具体费用取决于多种因素。
手术费用主要包括以下几个方面：
1.囊肿类型和大小：不同类型和大小的脑囊肿手术难度不同，费用也会有所差异。
2.手术方式：手术方式包括开颅手术和微创手术，微创手术费用相对较高。
3.医院级别和地区差异：不同级别的医院和地区，医疗费用也会有所不同。
4.并发症处理：如果手术中出现并发症，如出血、感染等，需要额外的治疗费用。
此外，还可能需要考虑一些其他费用，如术前检查、术后护理、药物费用等。
需要注意的是，以上费用仅供参考，实际费用可能会因个体情况和具体治疗方案而有所不同。在进行手术前，建议与医生详细沟通，了解具体的费用情况，并根据自身经济状况做出合理的决策。同时，医保政策也可能对部分费用进行覆盖，患者可以咨询医保部门了解相关报销政策。