阴茎上长小水泡可能是生殖器疱疹、尖锐湿疣、珍珠疹等疾病引起，也可能是其他原因导致。不同疾病的病因、症状和治疗方法不同，具体如下：
1.生殖器疱疹：由单纯疱疹病毒感染引起，通过性接触传播。感染后会出现红斑、丘疹、水疱，水疱易破溃形成糜烂或溃疡，伴有疼痛、瘙痒等症状。治疗方法主要包括抗病毒药物治疗、缓解症状治疗和局部处理。
2.尖锐湿疣：由人乳头瘤病毒感染引起，通过性接触传播。主要表现为外生殖器及肛门周围出现赘生物，呈乳头状、菜花状或鸡冠状，表面湿润或有出血。治疗方法包括物理治疗、药物治疗和免疫疗法。
3.珍珠疹：病因尚不清楚，可能与生理发育异常、包皮过长、局部刺激等有关。表现为阴茎冠状边缘和冠状沟出现的珍珠状、半透明丘疹，无自觉症状。一般不需要治疗，若患者有治疗需求，可通过激光、冷冻等方法去除。
4.其他原因：阴茎上长小水泡还可能是过敏、摩擦、感染等原因引起。
需要注意的是，以上内容仅供参考。如果发现阴茎上长小水泡，建议及时就医，明确诊断后进行针对性治疗。同时，要注意个人卫生，避免不洁性行为，避免搔抓和摩擦，以免加重病情。