局部感染风险增加
烂牙根若不拔除，残留的牙根组织会成为细菌滋生的温床，细菌不断繁殖可引发局部的感染。例如，可能导致根尖周炎，出现患牙部位的持续疼痛、肿胀，严重时面部会有明显肿胀，影响正常的进食和说话功能。对于儿童来说，乳牙的烂牙根感染还可能波及相邻的恒牙胚，影响恒牙的正常发育和萌出。
引发邻牙问题
烂牙根长期存在会对相邻牙齿造成不良影响。由于牙根缺失，相邻牙齿会向缺牙间隙倾斜移位，导致牙齿排列紊乱，进而影响咬合关系。比如原本排列整齐的牙齿，因为烂牙根的存在，相邻牙齿位置改变，可能引起食物嵌塞，而食物嵌塞又会进一步加重牙龈炎症等问题，对于青少年而言，牙齿排列紊乱可能影响面部美观和咀嚼功能的正常发育。
影响全身健康
局部的感染病灶可能成为潜在的致病菌来源，通过血液循环等途径影响全身健康。例如，口腔内的细菌及其毒素可能进入血液循环，进而影响心脏、关节等部位。有研究表明，慢性根尖周炎等由烂牙根引发的局部感染与一些心血管疾病、风湿性关节炎等疾病的发生存在一定关联。老年人本身身体机能下降，烂牙根导致的全身感染风险对其健康的威胁更大，可能会加重原本就存在的慢性疾病。
导致牙槽骨吸收
烂牙根持续刺激周围的牙槽骨，会引起牙槽骨的吸收。牙槽骨是牙齿的支撑结构，牙槽骨吸收会使牙齿的松动度增加，严重时可能导致牙齿脱落。对于不同年龄段的人，牙槽骨吸收的速度和程度有所不同，年轻人相对牙槽骨代谢活跃，但烂牙根长期存在也会较快破坏牙槽骨结构；老年人牙槽骨本身处于相对萎缩的状态，烂牙根引起的牙槽骨吸收会加速牙齿的松动脱落进程。