肚脐眼发臭可能是由以下原因引起的：
1.脐炎：脐部凹陷处极易积水、积污，潮湿温暖的环境又给细菌的生长繁殖提供了机会。脐炎轻者表现为局部有脓性分泌物，有臭味；脐周皮肤红肿；患儿发烧。重者形成脓肿，脓肿破溃后可形成慢性脐炎。
2.脐尿管瘘或脐卵黄管瘘：这是一种先天性疾病，由于脐尿管未完全闭合或脐卵黄管未完全闭合，导致脐部有分泌物排出，并有臭味。
3.脐茸：脐茸是小儿脐部的卵黄管残余组织增生物，又称为脐部息肉或脐息肉。表现为脐部有樱红色肿物，有少量分泌物，触之出血。
4.脐湿疹：脐窝处的皮肤娇嫩，因过敏或其他原因而发生皮疹，表现为丘疹、水疱，有渗出液、瘙痒等。
5.其他：如恶性肿瘤、脐尿管瘘、脐肠瘘等，也可导致肚脐眼发臭。
如果肚脐眼发臭，建议及时就医，明确病因，在医生的指导下进行治疗。同时，要注意保持脐部清洁干燥，避免搔抓和感染。