一般来说，怀孕5~6周时去做B超最好。
怀孕5~6周时，通过B超可以看到孕囊、卵黄囊和胎芽，确认宫内妊娠，排除宫外孕。如果月经周期不规律，或者排卵延迟，可能需要推迟做B超的时间。
此外，在怀孕早期，B超还可以帮助医生了解胚胎的发育情况，如孕囊的大小、形态、位置，胎芽的长度、胎心搏动等，从而评估胚胎的质量和健康状况。
需要注意的是，B超检查是一种安全的无创检查方法，但也不是越多越好。一般在孕期会进行3~4次B超检查，具体的检查时间和次数应根据个人情况和医生的建议来确定。
总之，怀孕5~6周时去做B超是比较好的选择，但具体情况还需咨询医生。