怀孕半个月药流是否干净，需要根据具体情况来判断。一般来说，药流适用于怀孕49天内的早期妊娠。在药流后，医生会通过B超等检查来确认孕囊是否完全排出，如果孕囊已经排出，且没有明显的残留组织，那么药流就算干净了。
但需要注意的是，药流也存在一定的失败率，如果药流不完全，可能会导致持续的阴道出血、腹痛等症状，甚至需要进行清宫手术。此外，药流还可能会引发一些并发症，如感染、药流不全等。因此，在药流后，需要密切观察身体状况，如果出现异常情况，应及时就医。
此外，药流也有一些禁忌症，如患有心脏病、高血压、糖尿病、肝肾功能不全等疾病的女性，以及宫外孕、带环妊娠等情况，都不适合进行药流。因此，在决定进行药流前，应该进行全面的身体检查，并在医生的指导下进行。
总之，怀孕半个月药流是否干净需要根据具体情况来判断，如果药流后出现异常情况，应及时就医。同时，药流也有一定的风险，应该在医生的指导下进行。