脑炎患者进行穿刺检查后，可能会留下一些后遗症，但这些后遗症并不是一定会出现的，而是与多种因素有关。以下是一些可能的后遗症：
1.头痛：穿刺检查后，患者可能会出现头痛的症状，这可能是由于穿刺过程中对头皮或颅骨造成的刺激引起的。一般情况下，这种头痛会在数天内自行缓解。
2.感染：穿刺检查是一种有创操作，如果操作不当或术后护理不当，可能会导致感染。感染的症状包括发热、头痛、颈项强直等。
3.出血：穿刺检查可能会导致局部出血，如果出血量较多，可能会出现血肿。
4.神经系统并发症：穿刺检查可能会对脑组织造成一定的损伤，导致神经系统并发症，如偏瘫、失语、癫痫等。
5.心理障碍：穿刺检查可能会给患者带来一定的心理压力，导致焦虑、恐惧、抑郁等心理障碍。
为了减少穿刺检查后后遗症的发生，医生会在检查前对患者进行详细的评估，包括病史、体格检查、实验室检查等，以确保患者适合进行穿刺检查。在检查过程中，医生会严格按照操作规程进行操作，尽量减少对患者的损伤。术后，医生会密切观察患者的病情变化，及时发现并处理可能出现的并发症。
需要注意的是，脑炎患者的病情较为复杂，穿刺检查只是诊断和治疗的一部分。在进行穿刺检查后，患者需要在医生的指导下进行后续的治疗和康复。同时，患者和家属也需要注意观察患者的病情变化，如有异常应及时就医。