怀孕66天内裤上总有褐色分泌物，可能是以下原因引起：
1.先兆流产：怀孕早期，胚胎着床不稳定，过度劳累、性生活、剧烈运动等可能导致先兆流产，出现阴道少量流血，血液在阴道内氧化后会呈现褐色。此时需要及时就医，进行超声检查、孕酮和人绒毛膜促性腺激素（hCG）检测等，以明确诊断。如果是先兆流产，需要卧床休息，必要时进行保胎治疗。
2.宫颈息肉：宫颈息肉是宫颈管黏膜的增生形成的赘生物，质地脆弱，容易出血。怀孕后，体内激素水平变化，可能会导致宫颈息肉增大，引起少量阴道流血。通常还会伴有白带增多、腰骶部酸痛等症状。需要进行妇科检查，明确诊断。如果息肉较大，需要在医生指导下进行手术摘除。
3.阴道炎或宫颈炎：怀孕后，体内激素水平变化，容易导致阴道菌群失调，引发阴道炎。如果炎症比较严重，也可能出现阴道少量流血。此外，宫颈炎也可能导致阴道分泌物增多、发黄，并伴有性交出血等症状。需要进行白带常规检查和妇科检查，明确诊断。如果是阴道炎，需要根据阴道炎的类型进行治疗；如果是宫颈炎，需要根据病情严重程度选择治疗方法，如药物治疗、物理治疗等。
4.其他：胎盘位置低、孕妇凝血功能异常等也可能导致怀孕早期内裤上总有褐色分泌物。
总之，怀孕66天内裤上总有褐色分泌物是一种异常情况，需要及时就医，进行相关检查，明确原因，并在医生的指导下进行治疗。同时，孕妇需要注意休息，避免劳累和性生活，保持外阴清洁，按时产检。