替硝唑与甲硝唑的不同之处在于：
1.用途：替硝唑用于治疗各种厌氧菌感染，如败血症、骨髓炎、腹腔感染、盆腔感染、肺支气管感染、肺炎等；甲硝唑主要用于治疗或预防上述厌氧菌引起的系统或局部感染，如腹腔、消化道、女性生殖系、下呼吸道、皮肤及软组织、骨和关节等部位的厌氧菌感染。
2.副作用：替硝唑的副作用相对较小，少数人可能会出现头痛、恶心、呕吐、眩晕、皮肤瘙痒、皮疹等；甲硝唑的副作用较多，常见的有恶心、呕吐、食欲不振、头痛、眩晕等，少数人可能会出现肢体麻木、共济失调、多发性神经炎等神经系统症状，还可能会引起白细胞减少、血小板减少等血液系统疾病。
3.适用病症：替硝唑对滴虫病、贾第鞭毛虫病也有一定疗效；甲硝唑对肠道和肠外阿米巴病、阴道滴虫病、小袋虫病和皮肤利什曼病等也有一定疗效。
需要注意的是，替硝唑和甲硝唑都属于处方药，应在医生的指导下使用，避免自行用药。同时，这两种药物都可能会与其他药物发生相互作用，因此在使用前应告知医生正在使用的其他药物。此外，对替硝唑或甲硝唑过敏者、有活动性中枢神经系统疾病和血液病者禁用。孕妇及哺乳期妇女用药需权衡利弊，哺乳期妇女用药期间应停止哺乳。