肛门内隐隐约约的疼可能由以下原因引起：
1.肛裂：肛管皮肤全层纵行裂开并形成感染性溃疡，多由便秘引起，典型症状为肛门疼痛、便血和便秘。
2.肛窦炎：常并发肛乳头炎，使乳头肥大。排便时肛门疼痛，可有排便不尽和下坠感。
3.血栓性外痔：肛门部突然剧烈疼痛，并出现暗紫色肿物。
4.肛管直肠周围脓肿：起病急，且逐渐加重，可有肛门部疼痛、发热、全身不适等症状。
5.内痔嵌顿：多有内痔病史，脱出的内痔未及时回纳，发生水肿、血栓形成、嵌顿而疼痛。
如果出现肛门内隐隐约约的疼，建议及时就医，明确诊断后进行相应的治疗。同时，在日常生活中，应注意保持肛门局部清洁，避免食用辛辣刺激性食物，养成良好的排便习惯，预防便秘。