新生儿肺炎引起的脑炎可能会留下一些后遗症，具体包括以下几个方面：
1.神经系统异常：脑炎可能导致新生儿的神经系统受损，出现智力障碍、脑瘫、抽搐、共济失调等问题。
2.运动障碍：患儿可能会出现肢体运动不协调、肌肉无力、瘫痪等症状。
3.听力和视力问题：脑炎可能影响听力和视力，导致耳聋、失明或听力下降、视力模糊等。
4.学习和行为问题：部分患儿可能会出现学习困难、注意力不集中、多动、情绪问题等。
5.发育迟缓：后遗症可能会影响新生儿的生长发育，导致身高、体重、头围等发育指标落后。
6.其他：脑炎还可能引发其他并发症，如脑积水、癫痫等。
需要注意的是，并不是所有新生儿肺炎引起的脑炎都会留下后遗症，后遗症的发生与脑炎的严重程度、治疗时机以及新生儿的个体差异等因素有关。如果新生儿患有肺炎并出现脑炎的症状，如发热、呕吐、抽搐、意识改变等，应及时就医，进行全面的检查和治疗。早期诊断和治疗可以降低后遗症的风险。此外，定期进行康复训练和评估，对于促进患儿的恢复和减少后遗症的影响也非常重要。如果对新生儿的健康有任何疑虑，建议咨询专业的医生或医疗机构，以获取个性化的建议和指导。