月经干净后两天同房出血，可能是以下原因导致：
1.子宫内膜未完全修复：月经刚结束时，子宫内膜尚未完全修复，此时同房可能导致其再次受损，引起出血。
2.妇科疾病：如阴道炎、宫颈炎、宫颈息肉等，这些疾病可能导致同房时接触性出血。
3.激素水平变化：在月经周期中，激素水平会发生变化，有时可能导致子宫内膜不稳定，容易出血。
4.其他因素：如动作过于激烈、使用某些药物等也可能引起出血。
如果出现这种情况，可以采取以下措施：
1.观察：出血量较少且无其他不适，可以先观察，注意休息，避免再次同房。
2.就医检查：如果出血量较多、持续时间较长或伴有其他不适，如腹痛、白带异常等，应及时就医，进行妇科检查、B超等检查，以确定具体原因。
3.治疗：根据检查结果，医生会制定相应的治疗方案。可能包括药物治疗、物理治疗或手术治疗等。
需要注意的是，每个人的情况可能不同，如果经常出现同房后出血，应及时就医，以便早期发现和治疗潜在的妇科疾病。此外，在治疗期间，应避免性生活，保持局部清洁卫生，按照医生的建议进行治疗和复查。