药流40天后试纸一深一浅，可能是以下原因。
1.药流不全：药流后，子宫内可能有残留的胚胎组织，导致试纸检测呈弱阳性。
2.再次怀孕：药流后，女性的卵巢可能在短时间内恢复排卵功能，若在此期间未采取避孕措施，可能会再次怀孕。
3.激素水平未恢复正常：药流后，体内的激素水平需要一段时间才能恢复正常，在此期间，试纸检测可能会出现弱阳性。
4.验孕试纸过期或使用不当：验孕试纸如果过期或保存不当，可能会影响检测结果。
如果药流40天后试纸一深一浅，建议及时就医，进行B超检查，以确定子宫内是否有残留组织，以及是否再次怀孕。同时，应注意个人卫生，保持外阴清洁，避免感染。此外，药流后应注意休息，加强营养，避免过度劳累和剧烈运动。如果有任何异常情况，应及时就医。