揉眼睛时有咯吱咯吱响，可能是由于以下原因：
1.空气进入：当我们揉眼睛时，手指压迫眼球，使眼球内部的压力暂时增加，从而将空气挤入眼球与巩膜之间的缝隙。空气在这个狭小的空间中流动，产生了类似咯吱咯吱的声音。
2.泪液排出：揉眼睛时，眼球表面的泪液会被挤出，同时可能会带动一些附属结构的运动，如睑板腺、结膜等，这也可能导致声音的产生。
3.关节活动：眼睛周围有一些小的关节，揉眼睛时这些关节可能会发生轻微的移动或摩擦，从而产生声音。
这种情况通常是正常的，不会对眼睛造成伤害。然而，如果揉眼睛时伴有疼痛、红肿、视力模糊等异常症状，可能是眼睛出现了问题，需要及时就医。
此外，为了保护眼睛的健康，我们应该避免频繁揉眼睛。如果眼睛感到不适，可以通过眨眼、休息、使用眼药水等方式来缓解。同时，保持良好的用眼习惯，如保持适当的用眼距离、控制用眼时间、定期进行眼部检查等，也有助于预防眼睛疾病的发生。