脚内侧骨头突出部位疼，可能是由于拇囊炎、跖痛症、扁平足等原因引起的。以下是一些可能的原因和治疗方法：
1.拇囊炎：
病因：拇囊炎是由于第一跖趾关节的长期磨损、退变，导致拇趾向外侧偏斜，第一跖骨头内侧形成骨赘，引起拇囊炎。
病因导致症状的原理：拇囊炎会导致局部的炎症反应，刺激周围的神经末梢，引起疼痛。
治疗方法：
非手术治疗：包括休息、冷敷、热敷、按摩、穿戴合适的鞋子等。
手术治疗：如果非手术治疗无效，可以考虑手术治疗，如拇囊切除术、跖趾关节融合术等。
2.跖痛症：
病因：跖痛症是由于跖骨头下的跖腱膜长期受到牵拉，引起跖腱膜的无菌性炎症，导致跖痛症。
病因导致症状的原理：跖腱膜的炎症会刺激周围的神经末梢，引起疼痛。
治疗方法：
非手术治疗：包括休息、冷敷、热敷、按摩、穿戴合适的鞋子等。
手术治疗：如果非手术治疗无效，可以考虑手术治疗，如跖腱膜松解术等。
3.扁平足：
病因：扁平足是由于足弓的塌陷，导致足底的压力分布不均匀，引起疼痛。
病因导致症状的原理：扁平足会导致足底的肌肉、韧带等组织长期受到过度的牵拉，引起疼痛。
治疗方法：
非手术治疗：包括休息、冷敷、热敷、按摩、穿戴矫形鞋垫等。
手术治疗：如果非手术治疗无效，可以考虑手术治疗，如软组织松解术、距下关节融合术等。
总之，脚内侧骨头突出部位疼可能是由于多种原因引起的，需要根据具体情况进行诊断和治疗。如果疼痛持续不缓解或加重，建议及时就医，以便明确病因，采取相应的治疗措施。