引起性行为时疼痛的原因较多，可能是生理因素，也可能与疾病有关，具体如下：1.生理因素：缺乏性知识：如果双方缺乏性知识，在进行性行为时，可能会因精神紧张、恐惧等，导致阴道痉挛，从而引起疼痛
性生活过频：如果性生活过于频繁，可能会导致阴道黏膜损伤，从而引起疼痛
处女膜闭锁：处女膜闭锁是一种先天性疾病，处女膜孔较小，经血无法排出，积聚在阴道内，可导致阴道扩张时出现疼痛
阴道炎症：如滴虫性阴道炎、霉菌性阴道炎等，炎症可导致阴道黏膜充血、水肿，在进行性行为时，可能会引起疼痛
其他：如果女性患有盆腔炎、子宫内膜异位症等疾病，也可能会引起性行为时疼痛。2.疾病因素：子宫内膜异位症：子宫内膜异位症是指子宫内膜组织生长在子宫腔以外的部位，可导致盆腔粘连，在进行性行为时，可能会引起疼痛
盆腔炎：盆腔炎是指女性生殖器官、子宫周围结缔组织及盆腔腹膜的炎症，可导致盆腔粘连，在进行性行为时，可能会引起疼痛
子宫肌瘤：子宫肌瘤是子宫平滑肌组织增生形成的良性肿瘤，较大的子宫肌瘤可能会导致宫腔增大、变形，在进行性行为时，可能会引起疼痛
其他：宫颈癌、子宫内膜癌等疾病也可能会引起性行为时疼痛。如果在进行性行为时出现疼痛，建议及时就医，明确原因，并进行针对性治疗。同时，在进行性行为时，应注意保持卫生，避免过度劳累，注意休息。