眼睛底下长小疙瘩，可能是以下原因引起：
1.粟丘疹：可由遗传、外伤、皮肤附属器受损等因素引起。一般为黄白色坚实性丘疹，顶尖圆，无自觉症状，通常无需治疗，可自行消退。若影响美观，可由专业医生消毒后用针挑破，挤出内容物即可。
2.汗管瘤：可能与遗传、内分泌等因素有关。通常表现为半球形或扁平丘疹，呈肤色或淡黄色，多发于女性。一般无需治疗，若影响美观或有治疗需求，可通过激光、冷冻等物理方法去除。
3.扁平疣：由人乳头瘤病毒（HPV）感染引起，具有传染性。主要表现为米粒至黄豆大小的扁平丘疹，颜色为肤色或淡褐色，好发于面部、手背等部位。可通过外用药物（如维A酸乳膏、咪喹莫特乳膏等）、物理治疗（如激光、冷冻等）或系统治疗（如使用抗病毒药物）来改善症状。
4.皮脂腺异位症：病因尚不清楚，可能与内分泌因素、局部刺激等有关。表现为针尖大小的淡黄色或白色丘疹，无明显自觉症状。一般无需治疗，若影响美观，可通过激光、电灼等方法去除。
5.脂肪瘤：由成熟的脂肪组织构成，可发生于身体任何有脂肪的部位。通常为单个或多个皮下局限性肿块，质地柔软，生长缓慢，一般无自觉症状。较小的脂肪瘤通常无需治疗，若瘤体较大，或出现疼痛、影响美观等情况，可手术切除。
6.其他：眼睛底下长小疙瘩还可能与其他疾病有关，如传染性软疣、皮肤纤维瘤、基底细胞瘤等。
需要注意的是，以上只是一些常见的原因，具体情况需要结合患者的症状、体征以及相关检查来综合判断。如果小疙瘩持续不消失或出现其他异常症状，建议及时就医，以便明确诊断并采取适当的治疗措施。