输尿管结石导致小便疼痛的原因主要有以下几点：
1.结石刺激：输尿管结石会刺激输尿管黏膜，导致局部炎症和水肿，从而引起疼痛。此外，结石在输尿管内移动时，也会引起疼痛。
2.梗阻：输尿管结石可能会导致输尿管梗阻，使尿液排泄不畅，肾盂内压力升高，从而引起疼痛。
3.感染：输尿管结石容易合并感染，感染会导致炎症反应，加重疼痛。
针对输尿管结石引起的小便疼痛，可以采取以下措施缓解疼痛：
1.多喝水：多喝水可以增加尿量，促进结石排出，同时也可以冲洗尿道，减轻疼痛。
2.药物治疗：可以使用一些止痛药，如布洛芬、对乙酰氨基酚等，来缓解疼痛。此外，还可以使用一些消炎药，如左氧氟沙星、头孢呋辛酯等，来控制感染。
3.体外冲击波碎石：如果结石较小，可以采用体外冲击波碎石的方法将结石击碎，使其排出体外。
4.手术治疗：如果结石较大或保守治疗无效，可能需要进行手术治疗，如输尿管镜取石术、经皮肾镜取石术等。
需要注意的是，输尿管结石可能会导致严重的并发症，如肾积水、肾功能损害等，因此如果出现小便疼痛等症状，应及时就医，进行详细的检查和治疗。同时，在治疗过程中，应注意休息，避免剧烈运动，同时要注意饮食调节，少吃含草酸和钙高的食物，以预防结石的复发。